Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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USP43Q70EL4 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
USP43Q70EL4 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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USP43Q70EL4 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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USP43Q70EL4 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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USP43Q70EL4 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
USP43Q70EL4 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USP43Q70EL4 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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USP43Q70EL4 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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USP43Q70EL4 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USP43Q70EL4 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
USP43Q70EL4 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
USP43Q70EL4 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
USP43Q70EL4 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
USP43Q70EL4 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
USP43Q70EL4 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
USP43Q70EL4 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
USP43Q70EL4 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
USP43Q70EL4 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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USP43Q70EL4 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USP43Q70EL4 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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USP43Q70EL4 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
USP43Q70EL4 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
USP43Q70EL4 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
USP43Q70EL4 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
USP43Q70EL4 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
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USP43Q70EL4 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP43Q70EL4 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
USP43Q70EL4 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP43Q70EL4 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP43Q70EL4 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP43Q70EL4 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
USP43Q70EL4 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP43Q70EL4 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP43Q70EL4 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP43Q70EL4 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP43Q70EL4 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP43Q70EL4 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP43Q70EL4 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
USP43Q70EL4 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP43Q70EL4 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP43Q70EL4 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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