Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC0.55□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC0.55□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
LAMA3Q16787 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC0.53□□□□□ -2.33
LAMA3Q16787 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.33
LAMA3Q16787 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
LAMA3Q16787 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
LAMA3Q16787 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LAMA3Q16787 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LAMA3Q16787 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
LAMA3Q16787 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
LAMA3Q16787 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
LAMA3Q16787 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
LAMA3Q16787 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LAMA3Q16787 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
LAMA3Q16787 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC0.52□□□□□ -2.33
LAMA3Q16787 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LAMA3Q16787 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
LAMA3Q16787 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LAMA3Q16787 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LAMA3Q16787 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
LAMA3Q16787 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC0.52□□□□□ -2.33
LAMA3Q16787 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
LAMA3Q16787 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
LAMA3Q16787 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
LAMA3Q16787 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
LAMA3Q16787 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
LAMA3Q16787 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
LAMA3Q16787 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
LAMA3Q16787 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
LAMA3Q16787 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
LAMA3Q16787 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
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