Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
FSCN1Q16658 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms