Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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