Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
ZIC1Q15915 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ZIC1Q15915 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ZIC1Q15915 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZIC1Q15915 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZIC1Q15915 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZIC1Q15915 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZIC1Q15915 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ZIC1Q15915 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ZIC1Q15915 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ZIC1Q15915 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ZIC1Q15915 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZIC1Q15915 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ZIC1Q15915 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZIC1Q15915 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZIC1Q15915 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ZIC1Q15915 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZIC1Q15915 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ZIC1Q15915 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZIC1Q15915 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ZIC1Q15915 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
ZIC1Q15915 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ZIC1Q15915 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ZIC1Q15915 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
ZIC1Q15915 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
ZIC1Q15915 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ZIC1Q15915 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
ZIC1Q15915 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
ZIC1Q15915 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZIC1Q15915 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZIC1Q15915 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZIC1Q15915 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZIC1Q15915 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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