Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC0.48□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.45□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
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