Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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