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| TTF1 | Q15361 | AL160394.1-201 | ENST00000624765 | 724 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| TTF1 | Q15361 | AC109471.3-201 | ENST00000625219 | 233 nt | TSL 5 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| TTF1 | Q15361 | SATB1-AS1-226 | ENST00000625515 | 776 nt | TSL 5 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| TTF1 | Q15361 | LINC01002-215 | ENST00000632203 | 314 nt | TSL 5 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| TTF1 | Q15361 | AL512643.1-201 | ENST00000635735 | 524 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| TTF1 | Q15361 | CEP170-202 | ENST00000366542 | 6828 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
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| TTF1 | Q15361 | ABCA5-208 | ENST00000588877 | 6525 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
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| TTF1 | Q15361 | RNA5SP267-201 | ENST00000364893 | 126 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
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| TTF1 | Q15361 | Y_RNA.534-201 | ENST00000384599 | 112 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| TTF1 | Q15361 | PPP3R1-202 | ENST00000409377 | 684 nt | TSL 3 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| TTF1 | Q15361 | RHEBP3-201 | ENST00000411920 | 351 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |