Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PCOLCEQ15113 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms