Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SHPRHQ149N8 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
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