Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SMCO1Q147U7 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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