Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
SMC1AQ14683 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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