Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1CQ13936 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.5 ms