Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TUBA3CQ13748 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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