Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms