Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SKP2Q13309 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
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SKP2Q13309 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
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SKP2Q13309 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
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SKP2Q13309 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
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SKP2Q13309 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
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SKP2Q13309 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
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SKP2Q13309 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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SKP2Q13309 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
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SKP2Q13309 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
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SKP2Q13309 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
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SKP2Q13309 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SKP2Q13309 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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