Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
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