Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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IFT88Q13099 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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IFT88Q13099 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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IFT88Q13099 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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IFT88Q13099 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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IFT88Q13099 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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IFT88Q13099 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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IFT88Q13099 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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IFT88Q13099 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
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IFT88Q13099 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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IFT88Q13099 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
IFT88Q13099 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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