Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PRDM2Q13029 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
PRDM2Q13029 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PRDM2Q13029 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PRDM2Q13029 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PRDM2Q13029 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PRDM2Q13029 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PRDM2Q13029 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
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