| FOXD4 | Q12950 | SFTA1P-203 | ENST00000446372 | 693 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC074327.1-201 | ENST00000448017 | 540 nt | TSL 2 BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC006539.3-201 | ENST00000454258 | 129 nt | BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC096666.1-201 | ENST00000454965 | 348 nt | TSL 3 BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | MTND1P12-201 | ENST00000455231 | 147 nt | BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | OFD1P4Y-201 | ENST00000455273 | 1179 nt | BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | DNAJC12-205 | ENST00000483798 | 769 nt | TSL 3 BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | RNU6ATAC13P-201 | ENST00000516152 | 131 nt | BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | SNORD19.2-201 | ENST00000516978 | 73 nt | BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | MRPL51-207 | ENST00000543959 | 472 nt | TSL 3 BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC007151.1-201 | ENST00000572774 | 483 nt | BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | OR1M4P-201 | ENST00000589199 | 287 nt | BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | IGKV1OR2-6-201 | ENST00000603485 | 277 nt | BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC244093.3-201 | ENST00000615419 | 411 nt | TSL 3 BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | C4orf22-209 | ENST00000621014 | 228 nt | TSL 3 BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | THOC1-220 | ENST00000621904 | 1083 nt | TSL 5 BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | FP236240.3-201 | ENST00000623061 | 327 nt | BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | SCARNA15.3-201 | ENST00000626315 | 122 nt | BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | SCARNA4.1-201 | ENST00000628597 | 123 nt | BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | MIR3199-2-201 | ENST00000636243 | 86 nt | BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | SKIL-203 | ENST00000426052 | 2757 nt | TSL 2 BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | CFHR4-204 | ENST00000608469 | 1601 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | KIAA1109-203 | ENST00000388738 | 15574 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | WRN-201 | ENST00000298139 | 5215 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | Y_RNA.3-201 | ENST00000362331 | 103 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | RNU6-461P-201 | ENST00000364195 | 107 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | RNU1-73P-201 | ENST00000383971 | 164 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | U8.11-201 | ENST00000384699 | 133 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | U8.12-201 | ENST00000384701 | 133 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | RNVU1-14-201 | ENST00000384770 | 164 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC068050.1-201 | ENST00000394891 | 380 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | MS4A4E-201 | ENST00000398984 | 479 nt | TSL 5 BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AL139397.2-201 | ENST00000404529 | 772 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | NDUFS5P1-201 | ENST00000405668 | 289 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | RNU2-62P-201 | ENST00000410868 | 191 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC114491.1-201 | ENST00000416095 | 246 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | HMGB3P20-201 | ENST00000417997 | 600 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC073311.1-201 | ENST00000420146 | 505 nt | TSL 5 BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | LINC01857-201 | ENST00000429730 | 492 nt | TSL 2 BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | GPM6BP2-201 | ENST00000432046 | 144 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC009296.1-201 | ENST00000443146 | 155 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | GPM6BP1-201 | ENST00000446387 | 144 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | U8.18-201 | ENST00000459285 | 133 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | RN7SL323P-201 | ENST00000494712 | 295 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | RPL37P25-201 | ENST00000507308 | 276 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC016553.1-201 | ENST00000513283 | 249 nt | TSL 3 BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | RNU5F-8P-201 | ENST00000515941 | 111 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC103796.1-201 | ENST00000530663 | 358 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC022240.1-201 | ENST00000532065 | 684 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | CYCSP30-201 | ENST00000546447 | 172 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC009135.1-201 | ENST00000549303 | 776 nt | TSL 2 BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | RPS3AP4-201 | ENST00000555161 | 764 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AL049775.2-201 | ENST00000557547 | 558 nt | TSL 4 BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC027807.1-201 | ENST00000559921 | 996 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC126407.1-201 | ENST00000563044 | 566 nt | TSL 4 BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC016229.1-201 | ENST00000589242 | 487 nt | TSL 5 BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | MTND4LP5-201 | ENST00000605152 | 292 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AL121992.2-201 | ENST00000606262 | 256 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AL627309.6-201 | ENST00000606857 | 840 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | U3.45-201 | ENST00000607547 | 219 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | DPY19L1-208 | ENST00000612226 | 607 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC084782.3-201 | ENST00000612282 | 578 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC138649.3-201 | ENST00000622154 | 254 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | U2.21-201 | ENST00000637295 | 81 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | OR4C15-202 | ENST00000642128 | 951 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | RFESD-202 | ENST00000380005 | 2587 nt | TSL 2 BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | RNF38-203 | ENST00000353739 | 4945 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | MTND5P26-201 | ENST00000426018 | 1752 nt | BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | OR5I1-201 | ENST00000301532 | 945 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | RNU6-181P-201 | ENST00000363225 | 107 nt | BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | Y_RNA.409-201 | ENST00000383990 | 98 nt | BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | MIR1-2-201 | ENST00000384961 | 85 nt | BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | BCL2L11-207 | ENST00000405953 | 425 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | MTND3P17-201 | ENST00000416968 | 344 nt | BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AP000907.1-201 | ENST00000428428 | 510 nt | BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AL355303.1-201 | ENST00000428920 | 680 nt | TSL 3 BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AL445488.1-202 | ENST00000430623 | 545 nt | TSL 3 BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | LINC01807-201 | ENST00000432481 | 676 nt | TSL 3 BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AL445687.1-201 | ENST00000439946 | 251 nt | BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | ATP2B2-IT1-201 | ENST00000440152 | 472 nt | TSL 3 BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC016696.1-201 | ENST00000446949 | 318 nt | BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC013269.3-201 | ENST00000450486 | 444 nt | TSL 3 BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | LINC01069-201 | ENST00000452933 | 546 nt | TSL 5 BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | MTATP6P7-201 | ENST00000453315 | 681 nt | BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | C1DP4-201 | ENST00000455429 | 424 nt | BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | RPS3AP17-201 | ENST00000472594 | 777 nt | BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC079349.1-201 | ENST00000509096 | 589 nt | TSL 2 BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC097460.1-201 | ENST00000514624 | 590 nt | TSL 3 BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC110296.1-201 | ENST00000515680 | 341 nt | TSL 3 BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | SNORA31.3-201 | ENST00000516029 | 96 nt | BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | RNU1-103P-201 | ENST00000516502 | 125 nt | BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | RN7SKP209-201 | ENST00000516888 | 304 nt | BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | RNU6-445P-201 | ENST00000516949 | 107 nt | BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | TRIQK-207 | ENST00000519069 | 598 nt | TSL 4 BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC060765.1-201 | ENST00000522776 | 544 nt | TSL 4 BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | C14orf105-204 | ENST00000526336 | 598 nt | TSL 4 BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | G2E3-AS1-202 | ENST00000550118 | 609 nt | TSL 5 BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AL391840.1-201 | ENST00000571144 | 367 nt | BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC069061.2-202 | ENST00000580280 | 357 nt | TSL 3 BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| FOXD4 | Q12950 | MIR3682-201 | ENST00000581338 | 84 nt | BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |