Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms