Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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HOXD10P28358 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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HOXD10P28358 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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HOXD10P28358 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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HOXD10P28358 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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HOXD10P28358 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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HOXD10P28358 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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HOXD10P28358 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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HOXD10P28358 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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HOXD10P28358 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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