Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP35Q9P2H5 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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