Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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