Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC0.53□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
SMG1Q96Q15 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
SMG1Q96Q15 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
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