Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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TRERF1Q96PN7 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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