Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
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