Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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SGCAQ16586 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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SGCAQ16586 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
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SGCAQ16586 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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SGCAQ16586 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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SGCAQ16586 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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SGCAQ16586 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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SGCAQ16586 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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SGCAQ16586 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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SGCAQ16586 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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SGCAQ16586 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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SGCAQ16586 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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SGCAQ16586 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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SGCAQ16586 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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