Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EXT1Q16394 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms