Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SKIV2LQ15477 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SKIV2LQ15477 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms