Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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NECTIN1Q15223 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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NECTIN1Q15223 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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NECTIN1Q15223 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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NECTIN1Q15223 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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NECTIN1Q15223 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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NECTIN1Q15223 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NECTIN1Q15223 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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