Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PCLAFQ15004 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PCLAFQ15004 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms