Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
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