Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PEX6Q13608 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms