Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
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