Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TOP3AQ13472 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC4□□□□□ -1.77
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