Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
AP3B2Q13367 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
AP3B2Q13367 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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