Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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GRIN2BQ13224 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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GRIN2BQ13224 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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GRIN2BQ13224 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIN2BQ13224 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIN2BQ13224 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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