Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms