Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
DUSP4Q13115 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DUSP4Q13115 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms