Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC0.47□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.4 ms