Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms