Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
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PTPRMP28827 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
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PTPRMP28827 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
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PTPRMP28827 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
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PTPRMP28827 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
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PTPRMP28827 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRMP28827 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRMP28827 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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