Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC0.63□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
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