Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.8 ms