Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC47Q96A33 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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CCDC47Q96A33 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC47Q96A33 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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