Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
C9orf47Q6ZRZ4 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms