Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCBE1Q6UXH8 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.3 ms