| CTXN3 | Q4LDR2 | AL159169.1-201 | ENST00000421119 | 127 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL512844.2-201 | ENST00000433990 | 593 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MTND4P25-201 | ENST00000441039 | 533 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL020998.1-201 | ENST00000444923 | 229 nt | TSL 3 BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RPL7P5-201 | ENST00000471472 | 736 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | C1orf112-206 | ENST00000472795 | 925 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | HMGN2P13-201 | ENST00000476476 | 274 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC116562.3-201 | ENST00000506136 | 177 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC034226.1-201 | ENST00000506429 | 487 nt | TSL 2 BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
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| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORA31.5-201 | ENST00000516190 | 133 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-506P-201 | ENST00000516553 | 94 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC103726.1-201 | ENST00000520785 | 474 nt | TSL 2 BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | ATP5F1P5-201 | ENST00000526403 | 760 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
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| CTXN3 | Q4LDR2 | AC005908.2-201 | ENST00000546078 | 530 nt | TSL 3 BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
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| CTXN3 | Q4LDR2 | AC007001.1-201 | ENST00000590912 | 670 nt | TSL 5 BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL391646.1-201 | ENST00000603860 | 190 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC073657.2-201 | ENST00000605661 | 303 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MSANTD4-206 | ENST00000617528 | 508 nt | TSL 5 BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MTND1P37-201 | ENST00000636562 | 264 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | OR5H6-203 | ENST00000642105 | 978 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | ADGRG2-206 | ENST00000360279 | 4702 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | PHTF2-202 | ENST00000275575 | 4541 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | NR3C1-212 | ENST00000504572 | 3389 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | KIAA1109-203 | ENST00000388738 | 15574 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.159-201 | ENST00000363674 | 87 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORA24.1-201 | ENST00000384401 | 135 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.516-201 | ENST00000384541 | 124 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL136116.1-201 | ENST00000403591 | 381 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL139397.2-201 | ENST00000404529 | 772 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU2-9P-201 | ENST00000410194 | 145 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU2-33P-201 | ENST00000410344 | 192 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNA5SP38-201 | ENST00000410750 | 119 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AF274854.1-201 | ENST00000413236 | 615 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MTATP6P18-201 | ENST00000417994 | 673 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL353678.1-201 | ENST00000422735 | 741 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC017074.1-201 | ENST00000424612 | 561 nt | TSL 3 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MTCO2P19-201 | ENST00000427513 | 598 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RPS15AP9-201 | ENST00000439856 | 381 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC079354.3-201 | ENST00000447111 | 311 nt | TSL 2 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC005008.2-202 | ENST00000447776 | 439 nt | TSL 3 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | FABP5P13-201 | ENST00000452144 | 328 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL358075.2-201 | ENST00000452785 | 339 nt | TSL 2 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-953P-201 | ENST00000459154 | 107 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC087588.1-201 | ENST00000462203 | 316 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RPS29P2-201 | ENST00000479278 | 136 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL160314.1-201 | ENST00000490836 | 438 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC136777.1-201 | ENST00000517765 | 369 nt | TSL 4 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC105031.3-201 | ENST00000524359 | 616 nt | TSL 3 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | ALKBH3-AS1-202 | ENST00000527960 | 547 nt | TSL 4 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | ZDHHC20P3-201 | ENST00000531576 | 336 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | OR5B19P-201 | ENST00000531766 | 928 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC100763.1-201 | ENST00000532735 | 522 nt | TSL 3 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | GLYCAM1-202 | ENST00000546607 | 553 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | HIGD1AP1-201 | ENST00000550979 | 275 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | TRAV28-201 | ENST00000557548 | 323 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC079203.2-201 | ENST00000559867 | 387 nt | TSL 2 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC034105.3-201 | ENST00000565294 | 442 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AP005264.4-201 | ENST00000592203 | 422 nt | TSL 5 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC025449.1-201 | ENST00000603896 | 529 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | HMGB1P50-201 | ENST00000605814 | 607 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL365204.3-201 | ENST00000612448 | 685 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RDM1-219 | ENST00000615378 | 542 nt | TSL 3 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC093648.1-201 | ENST00000623546 | 606 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | VPS8-228 | ENST00000628962 | 207 nt | TSL 5 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC244205.2-202 | ENST00000635781 | 342 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | ZNF66-201 | ENST00000344519 | 1745 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | CYYR1-AS1-201 | ENST00000357401 | 3412 nt | TSL 2 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL049641.1-201 | ENST00000441055 | 1948 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | POLK-217 | ENST00000515295 | 1438 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RASA1-202 | ENST00000456692 | 3776 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SYTL2-203 | ENST00000359152 | 4123 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | C5orf42-205 | ENST00000508244 | 11062 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | KCNJ16-203 | ENST00000392671 | 3981 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | UBE2L2-201 | ENST00000254302 | 429 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNA5SP374-201 | ENST00000362939 | 125 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-1167P-201 | ENST00000363227 | 94 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-179P-201 | ENST00000363350 | 107 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.505-201 | ENST00000384489 | 102 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR128-1-201 | ENST00000384921 | 82 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-817P-201 | ENST00000391083 | 104 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MTCO3P40-201 | ENST00000392516 | 676 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LINC00301-202 | ENST00000412599 | 772 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC106873.1-201 | ENST00000420664 | 459 nt | TSL 3 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | DPPA2P1-201 | ENST00000428060 | 556 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC007271.1-201 | ENST00000428188 | 382 nt | TSL 3 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | OR2B8P-201 | ENST00000432841 | 938 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LINC01797-202 | ENST00000433432 | 765 nt | TSL 3 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RPL36AP6-201 | ENST00000435770 | 321 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | HIGD1AP11-201 | ENST00000438361 | 280 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Z82210.1-201 | ENST00000440037 | 231 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC004691.1-201 | ENST00000440376 | 547 nt | TSL 3 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC093899.1-201 | ENST00000457984 | 376 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | FCF1P3-201 | ENST00000496394 | 590 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC108078.2-201 | ENST00000510750 | 236 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |