Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BBS9Q3SYG4 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms