Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC1.36□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC1.35□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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RTL8BQ17RB0 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC1.35□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
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RTL8BQ17RB0 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
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RTL8BQ17RB0 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
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RTL8BQ17RB0 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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RTL8BQ17RB0 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RTL8BQ17RB0 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.34□□□□□ -2.19
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